Ende des achten Jahrhunderts begann man mit der Errichtung einer außergewöhnlich groß angelegten Klosterkirche, die heute nach ihrem Erbauer als Ratgarbasilika bezeichnet wird. Es handelt sich dabei um die erste nachweisbare Doppelchoranlage im Frankenreich. Der Westbau dieser Anlage wurde an den Bau von Alt St. Peter in Rom angelehnt und dokumentiert damit die kirchenpolitische Bedeutung Fuldas im Reich. Er bildet den architektonischen Rahmen für das neu angelegte Bonifatiusgrab, das nun erkennbar zum Mittelpunkt der Kirche und zugleich Bestandteil der Klausur des Klosters wurde. In den heutigen Domtürmen sind die Türme der Ratgarbasilika noch erhalten.